为助力学校建成“服务粤港澳大湾区能力突出、侨校特色鲜明的高水平应用型大学”，2016年11月，学校将“创新创业教育服务中心”列为二级教学单位“创新创业学院”。

学院致力于打造“校地企协同、产学研贯通”的育人新格局，以卓越工程师培养为突破口，与中国移动、广悦电化、溢达纺织、保利粤中、海目星等龙头企业携手共建虚实结合的实习实训基地，累计建成5G移动通信、新型储能、现代纺织等高水平实验实训室5个；常态化举办小规模产业对接会，形成“企业出题、校企共答、企业阅卷”闭环合作模式。近两年，联合开设“卓越工程师创新班”15个。依托江门市卓越工程师创新人才培养中心，形成一支“懂理论、通技术、熟产业”的复合型导师队伍，已入库专家 95 人。

学院建立动态更新、精准匹配的企业需求项目库，累计征集产业技术创新需求176项；设立“五邑大学吴荣治创新创业基金”，通过“揭榜挂帅”机制，把企业真实技术需求转化为科研课题、教学项目、毕业选题。近两年，立项种子项目9项，带动30余家中小企业实现技术升级与产能提升。

八年来，学院紧扣立德树人根本任务，面向粤港澳大湾区重点产业链，构建“创新思维引领、创业能力赋能、产教融合驱动”的特色育人体系，实现从“点上突破”到“面上覆盖”的跨越。2024年，学生共获全国普通高校大学生竞赛排行榜内竞赛国家级、省级奖项424项；本科生参与各级各类创新创业实践活动达14642人次，占比78.49%。近两年，在中国国际大学生创新大赛中学校斩获国家级、省级奖项多项，其中金奖 1 项、银奖 9 项、铜奖 8 项；2025 年，全校各类学生项目立项达 2720 项，参赛学生 11285 人次，实现规模与质量的“双提升”。

学校先后获评“全国深化创新创业教育改革特色典型经验高校”“广东省大学生创新创业教育示范学校”，成为侨乡腹地最具活力的双创人才孵化高地之一。